Istituito come Sezione di Archivio di Stato con dm 12 giugno 1956, diviene Archivio di Stato a seguito del dpr 30 settembre 1963, n. 1409. L'Archivio di Stato di Frosinone estende la propria competenza su una provincia comprendente territori soggetti in passato allo Stato Pontificio e al Regno di Napoli: la documentazione conservata riflette la diversità delle istituzioni e trova il suo naturale completamento non solo nell’Archivio di Stato di Roma ma anche negli Archivi di Stato di Napoli e Caserta. È dotato di una biblioteca destinata specialmente ad uso interno, alla quale possono accedere quanti svolgono attività di ricerca relativamente ai fondi conservati o vigilati dall'Istituto e coloro che non possano reperire in altre biblioteche le pubblicazioni desiderate.